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发表于 2016-7-9 12:30:43
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生化-三羧酸循环
记忆方法：天龙八部。
宁异戊同，二虎言平。
一同平虎，两虎一能。
记忆前提：要熟悉每种物质的全名，如果名字都不知道，就不要考研了。
解释：
1，顺乌头酸这一步没有太大意义，很多书都将这一物质省略，所以，
口诀也没有考虑。三羧酸循环从乙酰 CoA 与草酰乙酸结
合开始，一共经过八个反应步骤，再回到草酰乙酸，我号称天龙八步，记住
的话，你可以一步一步，写出来，因为前一步的产物就是下
一步的原料，忘了一个环节，整个都可能记不起来。
2，最初原料：乙酰 CoA 与草酰乙酸大家应该都知道，所以从第二步起，6
宁异戊同：柠檬酸，异柠檬酸，a-酮戊二酸。现在大家都要讲究个性，干什
么都要别具一格，就叫做宁可异，也不要与人相同(为了
记忆，酮戊倒过来成了戊酮)
3，二虎言平(琥珀酰，琥珀酸，延胡索酸，苹果酸)：二虎相斗，必有一
伤。现在世界的主题是：和平和发展。为了人类的将来，共赢才是真理。所以，二虎相斗到最后，言平。
苹果酸后就回到了原料之一：草酰乙酸。
4，除了能记住反应步骤外，还要记住哪里产H，生成co2那里生成能量。
一同平虎：异柠檬酸，a-酮戊二酸，苹果酸脱氢反应生成 3 个 NADH+H+，琥珀酸脱氢生成1个 FADH2。山上出现一只吃人的老虎，所以大家一同(上山)平虎。另外，一同不光脱H，还脱了个CO2。
5，二虎一能：两只老虎对阵，你说中间好大的能量呀。产生一个高能磷酸键。
三羧酸循环亦称柠檬酸循环、Krebs 循环。
可以说是生物化学最重要的知识点，也是大家必须掌握和很难掌握的(至少可以说你能记住几个月)
循环的第一步是乙酰 CoA(2C)与草酰乙酸(4C)缩合成柠檬酸(6C)，
柠檬酸经一系列反应重新生成草酰乙酸，完成一轮循环。
主要事件顺序为：
(1)乙酰 CoA 与草酰乙酸结合，生成六碳的柠檬酸，放出 CoA。柠檬酸合成酶。
(2)柠檬酸先失去一个 H2O 而成顺乌头酸，再结合一个 H2O 转化为异柠檬酸。顺乌头酸酶(省略)
(3)异柠檬酸发生脱氢、脱羧反应，生成 5 碳的 a-酮戊二酸，放出一个CO2，生成一个 NADH+H+。异柠檬酸脱氢酶
(4)a-酮戊二酸发生脱氢、脱羧反应，并和 CoA 结合，生成含高能硫键的
4 碳琥珀酰 CoA，放出一个 CO2，生成一个 NADH+H+。酮戊二酸
脱氢酶
(5)碳琥珀酰 CoA 脱去 CoA 和高能硫键，放出的能通过 GTP 转入 ATP琥珀酰辅酶 A 合成酶
(6)琥珀酸脱氢生成延胡索酸，生成 1 分子 FADH2，琥珀酸脱氢酶
(7)延胡索酸和水化合而成苹果酸。延胡索酸酶
(8)苹果酸氧化脱氢，生成草酸乙酸，生成 1 分子 NADH+H+。苹果酸7
脱氢酶
小结：
一次循环，消耗一个 2 碳的乙酰 CoA，共释放 2 分子 CO2，8 个 H，其中四个来自乙酰 CoA，另四个来自 H2O，3 个 NADH+H+，1FADH2。此外，还生成一分子 ATP。
生化-摆动现象
从我开始 A U C【我(I)对应 A U C】
A C 配对很正常【A 对 U、C 对 G】
U G 配对多 U G【U 对 A G 正常外多了个 G】【G 对 C U 正常外多了个 U】
DNA 的双螺旋结构的数据记忆：01234
01 是 10 对碱基。
2 是螺旋直径 2nm。
3，4 是碱基平面的距离 0.34nm。
生化--氨基酸三字代码
上学的时候，MEET(met)了一个笨蛋(蛋氨酸)，名字叫阿丙(丙氨酸)，
我(Val)是(缬氨酸)他的(His)组(组氨酸)长，告诉他无数次 Ser 不念色(色
氨酸)，念丝(丝氨酸)，他却说他干(甘氨酸)不来(Gly)。无赖(赖氨酸)死(Lys)了，光(胱氨酸)说自己很有 SIZE(Cys)，要来一个五光十色(色氨酸)的 TRIP(Trp)，还要吃有很多 PROTEIN(Pro)的苏(苏氨酸)氏(Thr)果脯(脯氨酸),我就踹(Tyr 和 Try 很象)了他一脚落(酪氨酸)
起始密码:
AUG,联想"哎(A)哟(U)急(G)了,开始(起始)吧
生物化学 DNA 复制相关内容
原核生物:
DNApolⅠ:具有校读,填补,双向外切酶活性的单链大分子,可延长 20 个核苷
酸.⑴小片断:5,3 外切活性.⑵大片断(klenow):3,5 外切活性,也是实验的工具酶.
DNApolⅢ:具有 10 个亚基α(5,3 聚合活性),ε(3,5 外切),β(辨认引物,起滑动作用),θ(维持二聚体结构)的催化核苷酸聚合的不对称二聚体.
DNApolⅡ:双向外切活性.
总结:Ⅰ,Ⅱ有双向活性,Ⅲ有 5,3 聚合和 3,5 外切活性维持拓扑构想有三:解螺旋酶(DnaB),DNA 拓扑异构酶(切开,封闭,其中Ⅱ起主要作用),单链 DNA 结合蛋白(不断和 DNA 结合分离,保持单链完整).8DnaA 辨认起始点.DnaC 帮助 DnaB.引物酶是 dnaG 的基因产物.是一种 RNA 聚合酶.
引发体=引物酶+DnaB+DnaC+模板 DNA.引发体无 DnaA 是因为 DnaA
辨认之后促使 B,C 结合到 DNA 上,A 即被释放.
滚环复制见于低等生物和染色体外的 DNA,不需要引物.
真核生物
共五种 DNA-pol.
α和δ延长作用,其中α随从,δ领头
ε校读.修复
β其它无作用时才起作用
γ在线粒体内叫 mtDNA,易突变,与衰老有关.
质粒是染色体外的 DNA,是基因工程的常用载体.
RNA 引物由 RNA 水解酶水解,由 DNA-pol 加上.
端粒酶:是一种RNA-蛋白质.它RNA部分与DNA识别,部分作为模板逆转录
生成端粒,多是 TTAGGG 的重复.而不依赖与 DNA 作为模板.
⑴紫外线→嘧啶二聚体.
⑵5-溴尿嘧啶→A-G,
⑶羟胺类→T-C,
⑷亚硝酸盐→C-U,
⑸烷化剂:G→甲基化 G,
⑹镰刀贫血:谷→缬,
⑺地中海贫血:Hb 的β→δ,重排.
⑻膀胱癌:C-rasH 点突变,甘→谷,
⑼切除修复(UrvA 和 B 辨认结合损伤部位,urvC 切除):色性干皮病 XP 缺陷(DNApolⅠ和连接酶),
⑽重组修复:RecA 重组蛋白
⑾SOS 修复:uvr,rec,lexA,DNA-polⅡ参与修复,修复存活的 DNA 多有突变.
逆转录:需 Zn,引物为病毒本身的 tRNA.
密码子和反密码的摆动--igacu 09 贺银城书 234 页按照这个顺序记忆 i 对
应的正好是后三个为 acu g 对应的是后两个 cu a 对应的是最后一个 u
生化酶学，维生素辅酶有点容易忘，又常考.
鄙夷拳击踢屁屁硫胺素焦磷酸酯TPP(踢屁屁)，维生素B1(鄙夷)，转移醛基(拳击)9
嫌贫爱富反辛酸CoA(爱富)硫辛酸(辛酸)，泛酸(反+酸)，转移酰基(嫌)
古壁时而完归赵钴胺素(古)，维生素B12(壁时而)，转移烷基(完)
六一夺权转为安磷酸吡哆醛(夺权)，维生素B6 的一种(六一)，转氨酶(转为安)
一夜两声叹
一夜即一碳单位和四氢叶酸，两声即二氧化碳和生物素
维生素PP和NAD(辅酶一)，维生素B2和FAD/FMN(辅酶二)，均为氧化脱氢酶辅酶，递氢，太常遇到，应该不会记错吧。
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